Wymienię dwie podstawowe (moim zdaniem) wtyczki do szybkiego sprawdzenia i optymalizacji bazy danych (z funkcjonalności których korzystam raz na kilka miesięcy).

WP-Optimizeoptymalizacja bazy danych oraz usuwania „śmieci” z bazy, zbędnych wersji dla wpisów, spamowych komentarzy, pingbaków i trackbacków

Plugins Garbage Collector – kasuje konkretne tabele w nieodwracalny sposób dlatego należy z nią trzeba postępować ostrożnie. Przydatna dla bardziej zaawansowanych użytkowników WordPressa którzy znają lub chociażby orientują się w samych nazwach pluginów i tabel które te mogą tworzyć. Wtyczka przydaje się do usuwania tabel które pozostaną po pluginach (bo autor nie zadbał o poprawny unistaller i dlatego trzeba ręcznie podejmować decyzje które są nie używane już przez żadna wtyczkę)

wp-optumize

wp-plugin-garbage